一些上班族有早上空腹喝咖啡的習慣，覺得能排除毒素、振奮精神，還能起到減肥效果。然而，山醫大一院消化內科副主任醫師李曉麗介紹，咖啡因具有興奮心肌的作用，對咖啡因敏感的人飲用咖啡後，會導致血液中咖啡因濃度急劇上升，從而刺激中樞神經系統，造成眩暈、心跳加快、興奮、不安等精神症狀。咖啡因可致房室結的有效不應期縮短，從而引起各種快速性心律失常及早搏。因此，如果飲用咖啡後心慌、心悸、眩暈等，應當減少或避免咖啡因攝入。處於亞健康狀態的人、經常熬夜的人不宜長期大量喝咖啡，高血壓、心臟病患者也不宜喝咖啡。
李曉麗說，空腹喝咖啡之所以會有減肥效果，是因為腸胃經過一夜休息後，早晨空腹喝咖啡時，咖啡因會刺激腸胃，進而影響早餐正常的營養吸收，最終導致體重減輕。但這是非常不健康的做法，特別是有胃潰瘍和燒心症狀的人，要少喝或儘量不喝咖啡，否則會加重胃腸不適。
另外，咖啡加奶可避免鈣損失。“咖啡中的咖啡因有利尿作用，會增加尿液中鈣質的排洩，以及促進小腸中鈣質的分泌，有可能導致骨質疏鬆。”李曉麗說，日常食物中缺乏攝取足夠的鈣或是不經常動的人，特別是更年期後的女性，缺少雌激素會造成鈣質流失，這種情況下再攝入大量的咖啡因，可能會導致骨質疏鬆。平均每杯咖啡中的咖啡因只會增加2~3毫克的鈣流失。如果喝咖啡的時候新增純牛奶，那麼從牛奶中獲得的鈣用來彌補喝咖啡所造成的鈣損失還綽綽有餘。